灰原哀和柯南感到非常震惊，他们意识到自己陷入了一个危险的陷阱。他们必须想办法逃离这个地下室，并将这个发现告诉给柯南的朋友们。

经过一番艰苦的逃亡，灰原哀和柯南终于成功逃离了地下室。他们找到了柯南的朋友阿笠博士和小五郎侦探，向他们讲述了他们的经历和发现。

阿笠博士深思熟虑地说：“这个神社的历史和宝藏是一个很重要的线索，我们必须将其告诉警察局和FBI。这个神社可能涉及到更大的阴谋。”

于是，灰原哀、柯南、阿笠博士和小五郎侦探一起合作，将这个发现报告给了警察局和FBI。他们希望通过这个线索能够揭开黑暗组织的真相，保护更多的人们。

接着，警察局和FBI展开了一系列的调查行动，他们逐渐了解到这个秘密组织的规模之庞大。他们发现，这个组织涉及到了国际恐怖活动和非法贩卖文物等多个领域。

经过数月的艰苦追踪和调查，警察局和FBI终于成功地瓦解了这个黑暗组织。他们拘捕了组织的核心成员，并解救了被他们绑架的人质。

灰原哀和柯南成为了英雄，他们的勇敢和聪明帮助了警察局和FBI揭开了黑暗组织的真相。他们的事迹被媒体广泛报道，成为了全国范围的焦点。

尽管她年纪还小，灰原哀的聪明才智和勇气让人们为之惊叹。她的破解神社鸟居的惊人暗号，不仅找到了失散宝藏，还帮助揭开了黑暗组织的阴谋。她的聪明和勇敢将会铭记在人们的心中，成为一个永不磨灭的传奇。