在改革的过程中，朱杰展现出了坚定的决心和强硬的手段。他不仅对神职人员采取了严厉的措施，还将神社的建筑材料也用于城市的重建，以此彰显大明文化的优越性。与此同时，朱杰也意识到文化改革的长期性。为了使大明文化真正扎根于奈良城民心中，他推动了一系列的文化教育措施，鼓励城民学习大明文化，了解儒家思想，逐渐摆脱对平安京时期神社宗教的依赖。

然而，改革并非一帆风顺。竹内祭司在被捕后依然坚定地反对朱杰的宗教改革举措，他通过狱中的信使向外传递消息，鼓动其他神社的神职人员和信徒们起来反抗。一时间，奈良城内人心惶惶，局势动荡不安。

面对这一情况，朱杰展现出了高超的智慧和冷静的判断。他一方面加强了对被捕神职人员的看管和教育转化工作；另一方面，积极采取安抚民心的措施，向城民宣传大明文化的优越性和宗教改革的必要性，努力稳定奈良城的局势。

朱杰成功清除了奈良城中的大部分神社，推行大明文化，改革宗教。然而，仍有一些神社人员暗中作祟，企图颠覆朱杰的改革成果。

这些神职人员白天隐藏在奈良城的各个角落，躲避明军的搜捕。他们深知自己的行为激怒了朱杰，也知道被捕的下场将会十分悲惨。然而，他们仍抱着一丝希望，不断触碰明军的底线，企图制造混乱，恢复神社的势力。

一到夜晚，这些神职人员便如同鬼魅般出没，聚集在一起，趁着黑暗的掩护，对明军驻守的营帐进行一系列的破坏行动。他们朝营帐扔火把，掷各种垃圾，肆意妄为，发泄心中的不满与怨恨。熊熊烈火照亮了黑夜，营帐在火光中化为灰烬，留下的只是残破的旗帜在风中飘扬。

朱杰在得知这一情况后，十分愤怒。他深知这些神职人员是改革的最大阻碍，如果不彻底清除他们，改革将难以顺利进行。于是，他下定决心，要将这些神职人员彻底全部抓捕归案。

为了实现这一目标，朱杰精心策划了一场大规模的搜捕行动。他调集了大量的明军士兵，对奈良城进行了严密的封锁和搜索。无论是街头巷尾，还是深宅大院，都不放过任何蛛丝马迹。同时，他还派出密探和间谍，打探这些神职人员的行踪，以掌握他们的动态。

在这次搜捕行动中，许多神职人员被捕获。他们被押送到朱杰的面前，面对着威严的明军统帅，他们不得不低头认罪。